Cơ quan quản lý Di tích lịch sử Dinh Độc lập là Hội trường Thống Nhất. Căn cứ Quyết định 757/QĐ-VPCP ngày 10 tháng 5 năm 2010 của Bộ trưởng, Chủ nhiệm Văn phòng Chính phủ qui định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức và chế độ quản lý tài chính của Hội trường Thống Nhất, thì Hội trường Thống Nhất là đơn vị sự nghiệp có thu thuộc Văn phòng Chính phủ có chức năng quản lý, bảo tồn, tôn tạo Di tích lịch sử văn hóa Dinh Độc lập; phục vụ đại biểu, khách tham dự các cuộc họp, hội nghị của Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ và Văn phòng Chính phủ; các hội nghị và hoạt động khác của Đảng, Nhà nước, Quốc hội khi có yêu cầu; được tận dụng cơ sở vật chất, lao động để kinh doanh dịch vụ theo qui định của pháp luật.

Hội trường Thống Nhất hiện có các phòng chức năng sau:

- Phòng Nghiệp vụ Thuyết minh
- Phòng Kế hoạch Tài vụ
- Phòng Bảo vệ
- Phòng Hành chính Tổ chức
- Phòng Quản trị
- Nhà khách 108 Nguyễn Du
- Nhà khách 17 Thùy Vân, thành phố Vũng Tàu, tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu

Trong nhiều năm qua, tập thể cán bộ, nhân viên Hội trường Thống Nhất luôn đoàn kết nhất trí cao, phát huy cao ý thức trách nhiệm đối với công việc, chủ động, sáng tạo hoàn thành tốt công tác quản lý, bảo tồn và phát huy giá trị Di tích lịch sử Dinh Độc lập và hoàn thành xuất sắc các nhiệm vụ do lãnh đạo Văn phòng Chính phủ giao. Năm 2010, Hội trường Thống Nhất đã vinh dự nhận Cờ thi đua của Chính phủ và được Chủ tịch nước Cộng hòa Xã hội Chủ nghĩa Việt Nam tặng thưởng Huân chương Lao động hạng I.